潔淨空調係統是指利用物理方法對空氣進行各種處理（如加熱、加濕、幹燥、冷卻、潔淨等），通常由冷（熱）源、空氣處理設備、通風係統、水係統及自動控製和調節裝置五大部分組成，而潔淨空調是要解決來自生產車間的內外幹擾因素對室內空氣的輸送與分配所產生的矛盾。製藥企業所用的空調係統是一個複雜的係統，包括空氣處理機組、輸送管道、過濾裝置及末端送風裝置等，它不僅要求把符合溫濕度等要求的空氣輸送至需要的房間或區域，還要保證輸送的空氣中的塵粒數也要達到一定的要求，即滿足一定的潔淨度要求。
　　
　　1、 冷（熱）源
　　
　　冷源是為空氣處理設備提供冷量以冷卻送風空氣。常用的空調冷源是各類冷水機組，它們提供低溫水（例如7℃）給換熱設備，以冷卻空氣，也有用製冷係統的蒸發器來直接冷卻空氣的；熱源是用來提供加熱空氣所需的熱量，常用的空調熱源有熱泵型冷水機組、各類鍋爐、電加熱器等。
　　
　　2、 空氣處理設備
　　
　　空氣處理設備的作用是將送風空氣處理到規定的狀態。常用的空氣處理設備有空氣過濾器、空氣冷卻器、空氣加熱器、空氣加濕器等。
　　
　　3、 風係統
　　
　　包括送風係統和排風係統。送風係統的作用是將處理過的空氣送到相應的功能間，其基本組成部分是風機、風管係統和室內送風口裝置。風機是使空氣在管內流動的動力設備；排風係統的作用是將空氣從室內排出，並將排風輸送到規定地點，可排至室外，也可將部分排風送至空氣處理設備與新風混合後作為送風。重複使用的這一部分排風稱為回風。排風係統的基本組成是室內排風口裝置、風管係統和風機。
　　
　　4、 水係統
　　
　　水係統是將冷媒水或熱媒水從冷源或熱源輸送至空氣處理設備。空調水係統的基本組成是水泵和水管係統。空調水係統分為冷（熱）水係統、冷卻水係統和冷凝水係統3大類。
　　
　　5、 自動控製和調節裝置
　　
　　由於空調係統的冷熱負荷是多變的，這就要求空調係統的工作狀況也要有變化。所以，空調係統應裝備必要的控製和調節裝置，來調節送風參數、送排風量、供水量和供水參數等，以維持所要求的室內空氣狀態。